硬纤维瘤，亦称为侵袭性纤维瘤病，是一种局部侵袭性肿瘤，虽然不具备转移能力，但其复发率极高，严重影响患者的生活质量。目前，对于硬纤维瘤的分子机制的研究仍显不足，这使得患者的治疗选择受到限制。本研究旨在开发新的硬纤维瘤预后标志物，并验证已有相关标志物，以深入探讨硬纤维瘤在基因组、表观基因组和转录组层面的分子异质性，从而为精准治疗提供理论依据。

在本研究中，我们对20例原发性硬纤维瘤的31个样本进行了RNA-seq分析，发现14个基因在复发和未复发患者之间呈现差异表达。然而，这些基因在患者组内及同一肿瘤的不同区域表现出高度可变性。我们还验证了前两项研究中提到的预后基因表达特征，结果显示不同患者及同一肿瘤内的这些基因表达存在显著异质性。例如，在Salas研究中的36个基因特征中，唯有FECH基因在复发和未复发的肿瘤中呈现显著差异表达，但与原研究结果相悖。而Kohsaka研究中的IFI6和LGMN基因在本研究中未表现出与复发相关的差异表达，并且在同一肿瘤内也展现出异质性。通过免疫组化技术（IHC），我们在蛋白水平验证了这些标志物的可变表达，与局部复发无明显关联，进一步确认了基于基因表达特征的预后分类受肿瘤取样区域的影响。

在对患者的基因组系统发育及多组肿瘤异质性进行深入分析时，我们发现原发性肿瘤和复发性肿瘤之间存在明显的DNA拷贝数改变及DNA甲基化、转录组特征的差异。原发性肿瘤的某一区域展示出独特的转录组特征，富集与线粒体氧化磷酸化途径相关的基因，部分基因的表达与甲基化状态呈负相关关系。这种高度的分子异质性表明，针对于硬纤维瘤的单肿瘤活检的分子分析可能低估了其分子改变的程度，且分子特征随肿瘤的发展而发生演化，这对药物研发和生物标志物的验证具有重要意义。

总结而言，本研究首次全面揭示了硬纤维瘤在基因组、表观基因组及转录组层面的高度肿瘤内和肿瘤间异质性，表明未来需在临床中注重多组学检测。通过新葡萄8883官网AMG的全面多组学服务平台，我们将为硬纤维瘤的临床治疗提供更为精准的数据支持，从而提升患者的生活质量。

未来的研究方向将聚焦于利用新葡萄8883官网AMG所提供的优质产品和服务，涵盖表观组学、转录组学、蛋白质组学及代谢组学，进一步提升硬纤维瘤的治疗效果和预后评估。